基础医学
丁璟1, 杨鑫鑫1, 邹雪琴1, 高淑君1, 刘雪1, 潘玲丽1,张鳅丹1, 赵杨静1, 梁秀婷2,王荟1, 朱彦玲2, 邵启祥1
2021, 31(05): 391-395.
目的: 探讨lncRNA44372在卵巢癌中的表达及其在卵巢癌发生发展过程中的作用机制。方法: 从NCBI GEO数据库中下载卵巢癌样本及其对照样本的基因芯片数据GSE119054,选用在线工具CRN分析在卵巢癌中差异表达的lncRNA;利用在线工具Annolnc筛选与lncRNA44372有关的共表达基因,然后使用David进行基因本体论(Gene Ontology,GO) 分析、信号通路富集分析;通过starbase构建lncRNA44372可能存在的竞争性内源RNA网络;用qRTPCR检测lncRNA44372在卵巢癌细胞系中的表达。结果: GSE119054数据集中筛选出在卵巢癌中表达上调的lncRNA有6个,表达下调的lncRNA有 4个;GO分析显示,与lncRNA44372相关的共表达基因在细胞凋亡、细胞周期调控和蛋白苏氨酸/酪氨酸磷酸酶活性中具有调控作用。信号通路分析显示,与lncRNA44372相关的共表达基因主要参与细胞凋亡、肿瘤形成及发展相关的信号通路。lncRNA44372可与miR190和miR193结合并调控Unc51自噬激活激酶2(ULK2)和依赖LON的过氧化物酶体2(LONP2)在卵巢癌中的表达。qRTPCR结果显示,lncRNA44372在卵巢癌细胞系中表达量较卵巢正常细胞系低(P<0.05)。结论: lncRNA44372在卵巢癌中呈低表达,其可能通过影响细胞凋亡、细胞周期等参与卵巢癌的发生发展。