纳米孔测序专题
秦大妮, 马铁梁, 沈惠平,等
江苏大学学报:医学版.
2023, 33(06):
493-497.
目的: 分析哮喘患儿上呼吸道菌群定植种类和数量与健康儿童之间的差异。方法: 选择2020年10月至2021年10月我院收治的8例学龄前哮喘患儿入哮喘组,另纳入18例同期在我院体检的健康儿童为对照组,分析两组之间呼吸道菌群种类及数量的差异。结果: 16S rDNA测序结果显示,哮喘患儿上呼吸道菌群物种丰富度及多样性增加,菌群结构发生显著变化。哮喘组和对照组共有扩增子序列变异(amplicon sequence variants,ASVs)375个,特有ASVs分别为889个和1 037个,哮喘组菌群ASVs相较于对照组发生显著变化。在门水平,与对照组比较,哮喘组中厚壁菌门的相对丰度明显下降(P<0.01),放线菌门(Actinobacteria)、梭杆菌门(Fusobacteria)、弯曲杆菌门(Campilobacterota)的相对丰度明显增加(P<0.05)。在属水平,与对照组比较,哮喘组链球菌属、鞘氨醇单胞菌属相对丰度减少,奈瑟菌属(Neisseria)相对丰度明显增加,差异均有统计学意义(均P<0.05)。结论: 哮喘患儿上呼吸道菌群在种类和数量上与健康儿童之间存在显著差异,且哮喘患儿存在呼吸道菌群紊乱状态。